Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
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GRIN2AQ12879 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2AQ12879 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2AQ12879 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
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