Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NIPAL4Q0D2K0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms