Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSM1Q08AH1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms