Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms