Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POLEQ07864 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLEQ07864 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POLEQ07864 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POLEQ07864 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
POLEQ07864 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms