Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC3A1Q07837 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms