Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PAX8Q06710 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms