Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TNP2Q05952 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms