Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GRIN1Q05586 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms