Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLTCQ00610 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms