Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGD1P98174 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGD1P98174 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGD1P98174 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD1P98174 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD1P98174 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms