Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CBX1P83916 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX1P83916 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX1P83916 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX1P83916 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX1P83916 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX1P83916 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CBX1P83916 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CBX1P83916 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms