Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A1P68400 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms