Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VBP1P61758 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms