Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVPABLB-1P60509 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVPABLB-1P60509 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms