Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCBP3P57721 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms