Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP1B3P54709 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms