Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBX2P52951 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms