Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GTF2A1P52655 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms