Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ETV1P50549 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ETV1P50549 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ETV1P50549 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms