Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM4P49221 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM4P49221 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM4P49221 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM4P49221 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM4P49221 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms