Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GCLMP48507 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GCLMP48507 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCLMP48507 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCLMP48507 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCLMP48507 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GCLMP48507 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms