Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTRNP46939 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTRNP46939 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UTRNP46939 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UTRNP46939 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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