Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRXP46100 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms