Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC3AP31941 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms