Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA10P31260 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA10P31260 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms