Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2E1P29083 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2E1P29083 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms