Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHATP28329 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHATP28329 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHATP28329 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHATP28329 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms