Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRHP20396 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRHP20396 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRHP20396 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRHP20396 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRHP20396 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRHP20396 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms