Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTLA4P16410 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms