Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms