Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C8orf88P0DMB2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C8orf88P0DMB2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms