Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA4P06727 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA4P06727 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms