Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZBED1O96006 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZBED1O96006 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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