Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNOT4O95628 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms