Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIAH2O43255 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms