Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNPHO15079 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNPHO15079 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNPHO15079 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNPHO15079 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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