Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms