Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IQCJ-SCHIP1C9J366 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms