Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF879B4DU55 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms