Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL3A8MV65 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms