Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A0A0B4J203 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms