Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MAP3K4Q9Y6R4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MAP3K4Q9Y6R4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms