Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms