Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HHLA3Q9XRX5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms