Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP24Q9UPU5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms