Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNX12Q9UMY4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms