Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLEC4AQ9UMR7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLEC4AQ9UMR7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms