Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms