Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXD3Q9UJU5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms